La cour Canel a fait l'objet, à la fin du 20e siècle, de nombreux travaux de restaurations, tant du point de vue de la voirie que des bâtiments. Acquise par la municipalité en 1980, elle consistait en une bande de terrain desservant les immeubles depuis la rue de la République jusqu'à la rivière des Carmes, bornée au nord par un muret délimitant la propriété du musée. L'ensemble, devenu domaine public, a fait l'objet de plusieurs phases de travaux de rénovation, tant sur le pavage que sur les élévations, afin de permettre une lecture plus globale du paysage, à savoir une cour desservant un ensemble de monuments importants : le musée, ancienne maison d'Alfred Canel, et la série de bâtiments mitoyens du 16e siècle. A la fin des années 1980, l'architecte Parléani réalise une première réhabilitation de la cour avec un muret conservé mais abaissé et servant plus d'élément structurant le paysage que de délimitation de parcelle. Le deux piliers formant l'entrée du musée, via une courette, sont également supprimés laissant un espace ouvert sur l'entrée du bâtiment. A cette occasion, est également enlevé l'édifice construit au début du 20e siècle et faisant office de cuisine. En 2004, à la suite des travaux de réhabilitation et d'agrandissement du musée, la cour Canel est réaménagée avec notamment un pavage en granit et la mise en place de mobilier, passerelles et platelage bois permettant un passage, par le ruisseau des Carmes, vers la place du général de Gaulle.