La création d'un bâtiment destiné à accueillir les bureaux chargés de surveiller les mouvements de la navigation dans le port militaire est étudiée à partir de 1838, suite aux dépêches ministérielles des 28 décembre 1836 et 14 janvier 1837. Initiée en 1841, suite à la décision ministérielle du 10 mars, la construction du bâtiment, oeuvre de l'ingénieur des Ponts et Chaussées Félix-Jean-Baptiste-Joseph Reibell, directeur des Travaux hydrauliques, ne s'achève que dans les années 1850 après qu'un gigantesque incendie, survenu le 4 mars 1847, eut ravagé le second étage et les combles de l'édifice. Siège du bureau du directeur, des agents comptables et de nombreux agents administratifs, le bâtiment, détruit lors de l'incendie de l'arsenal par les Allemands en juin 1944, abrite également, au début de son inauguration, les ateliers de la voilerie ainsi que des magasins pour accessoires, avant leur transfert définitif dans les locaux du Magasin Général inauguré en 1865.